Das alternativas propostas, qual a que se encontra estruturas funcionalmente antagônicas:

Resposta: D) Mitocôndrias e cloroplastos.

Essas dois organelas citoplasmáticas apresentam estruturas funcionalmente antagônicas. As mitocôndrias são responsáveis pela produção de energia para a célula, através do processo de respiração celular, enquanto os cloroplastos são responsáveis pela produção de nutrientes, por meio da fotossíntese.

Enquanto as mitocôndrias geram energia a partir da quebra de moléculas orgânicas, os cloroplastos utilizam a luz solar para produzir compostos orgânicos. Portanto, essas duas organelas apresentam funções opostas, mas complementares, pois a energia gerada pelas mitocôndrias é utilizada para sustentar a síntese de nutrientes realizada pelos cloroplastos.

Além disso, as mitocôndrias são encontradas em quase todas as células eucariotas, enquanto os cloroplastos são exclusivos das células vegetais e de algumas algas, o que reforça a ideia de que essas organelas têm funções diferentes e complementares.

Já as outras opções não apresentam estruturas funcionalmente antagônicas. Os cílios e flagelos são estruturas responsáveis pelo movimento celular, o cromonema e cromátides são estruturas relacionadas ao material genético, a plasmalema e membrana plasmática são estruturas que delimitam a célula e controlam a entrada e saída de substâncias, e os vacúolos e complexo de Golgi são estruturas relacionadas ao processamento e armazenamento de substâncias.