Sobre a sociedade colonial nos séculos XVI e XVII, é correto afirmar que:

A alternativa correta é letra A) A aristocracia rural era constituída pelos colonos, detentores de grandes propriedades rurais.

Vamos analisar cada alternativa:

A) A aristocracia rural era constituída pelos colonos, detentores de grandes propriedades rurais.

CORRETO. A aristocracia rural, também conhecida como "elite agrária" ou "senhores de engenho", era constituída pelos colonos portugueses que detinham grandes propriedades rurais, especialmente engenhos de açúcar. Estes indivíduos possuíam grande poder econômico e social, e dominavam a política local.

B) Havia grupos sociais intermediários constituídos de pequenos proprietários, agregados, funcionários públicos e escravos ricos.

INCORRETO. Apesar de existirem grupos sociais intermediários, como pequenos proprietários e funcionários públicos, a ideia de "escravos ricos" é incoerente com a realidade da sociedade colonial, onde a escravidão era uma condição de exploração e subjugação. Os escravos, na sua grande maioria, não tinham posses ou riquezas.

C) Os sacerdotes católicos, quando detentores de latifúndios ou de recursos financeiros significativos, adquiriam o direito ao voto e de participação na administração das Câmaras.

INCORRETO. Os sacerdotes católicos, apesar de terem um papel importante na sociedade colonial, principalmente na educação e na evangelização dos indígenas, não tinham direito ao voto ou de participação na administração das Câmaras por serem membros do clero. A função deles era estritamente religiosa e não tinham envolvimento direto com a política.

D) Pelo Direito de Padroado, os clérigos recebiam os privilégios próprios dos magistrados e de constituir família, nas regiões das minas.

INCORRETO. O Direito de Padroado era um acordo entre a Igreja e o Estado, onde este último tinha o direito de nomear os membros do clero e em troca garantia a manutenção da fé católica nas suas terras. No entanto, este direito não conferia aos clérigos privilégios de magistrados ou a possibilidade de constituir família, uma vez que o celibato era (e ainda é) uma das obrigações do clero católico.

E) Os Cristãos Novos, Judeus e Calvinistas eram aceitos como cidadãos na colônia quando admitissem publicamente sua origem aos visitadores inquisitoriais.

INCORRETO. Os Cristãos Novos (judeus convertidos ao cristianismo), judeus e calvinistas eram vistos com desconfiança e frequentemente perseguidos pela Inquisição. Admitir publicamente sua origem ou crença não garantiria a aceitação como cidadãos, mas poderia resultar em perseguição, tortura e até morte.

Portanto, a alternativa correta é a LETRA A.